分析系統及測序平臺

分析系統

宏微 RPD-seq? Server 是由賽哲生物自主研發的、針對病原微生物宏基因組檢測產品的、集樣本管理-數據分析-數據管理于一身的專業生物信息分析平臺,可實現病原微生物宏基因組檢測數據的快速分析,滿足科室內多用戶共用測序儀進行各自數據分析并保證每個用戶數據保密性以及本地化操作的臨床需求。

RPD-seq? Server 六大優勢

  • 分析本地化
  • 報告自動化
  • 操作界面化
  • 數據保密化
  • 流程模塊化
  • 管理統一化

實驗室構建

賽哲提供「實驗室測序平臺+分析系統」構建服務,可協助客戶單位構建標準化、專業化、一體化的微生物測序平臺,歡迎咨詢:400-888-4242(轉1)

資源 1

測序平臺

賽哲生物與全球測序領域巨頭illumina公司簽訂了《臨床診斷產品商業化與供應協議》,達成戰略合作,開展微生物領域的檢測項目。

賽哲生物是illumina中國首家授權開發診斷試劑的企業,也是唯一一家儀器試劑捆綁報證的單位。

目前,賽哲生物醫學服務中心配備有Illumina國際主流測序平臺,根據樣本及通量情況,可提供iSeq、MiniSeq、MiSeq、NextSeq、NovaSeq等多種高通量平臺測序服務。其中illumina MiSeq Dx、NextSeq 550Dx已通過FDA和CE-IVD注冊,MiSeq Dx更通過了中國CNDA批準,可應用于臨床體外診斷領域的測序服務。

illumina NovaSeq 6000

全新的NovaSeq系列測序系統,突破技術革新,具有可擴展的通量、靈活簡便的配置和簡化的操作流程,允許以更大的深度來發現罕見的遺傳變異,為大規模發現復雜疾病變異打開了全新的市場。NovaSeq 測序平臺單次運行最多可檢測48個人類基因組,產出 6Tb 的數據量,運行時間縮短至40個小時。

  • 通量范圍:4800-6000 Gb
  • 每次運行reads數:32-40 B
  • 最大讀長:2 × 250 bp

可擴展的通量

為了滿足不同用戶的需求,NovaSeq系列提供兩種配置。NovaSeq 5000系統為一系列廣泛的應用提供成本高效益的高通量測序。NovaSeq 6000系統以每個樣品最低的花費為這些應用提供前所未有的通量。無論選擇哪一種系統,您都能得到與您研究相匹配的通量。

高度靈活

NovaSeq系列擴展度大、靈活簡便,能夠適應各種不同的應用和項目規模,同時達到最大的操作效率。用戶可以同時運行1個或2個流動槽,并有4個流動槽類型可供選擇, 輕松地調節每個測序運行的產出。可對數據產出靈活調節,因此您能夠運行包含任何測序方法、基因組和規模的項目。

廣泛的應用范圍

NovaSeq系列與大部分Illumina文庫制備套件相兼容,從轉錄組測序到全基因組測序,及其中的一切。高質量、高覆蓋度的測序為基因組提供了綜合的視野,能夠精確發現變異、描繪異構體的特征并做更多事情。由于有著更高的通量和每個樣品更低的單價,NovaSeq系列非常適合數據密集型的應用。

簡化的操作

NovaSeq系列將我們臺式測序儀簡便易用的特點和高通量測序平臺的威力結合在了一起。該系列提供了全自動機載簇生成,最大程度縮短了手動操作時間。集成的試劑盒隨時可用,簡化了運行設置,防止了不當上樣。具有射頻識別編碼的耗材能夠全自動追蹤試劑。概括來講,在NovaSeq 5000系統或NovaSeq 6000系統上設置一個運行只需幾分鐘時間,提高了您的實驗室效率。

illumina NextSeq 550Dx

NextSeq 550Dx儀器已獲得FDA批準和CE-IVD認證,可幫助臨床實驗室開發和開展廣泛的應用,從使用靶向panel進行NGS IVD分析,到包含靶向panel和全基因組等的臨床研究應用。

  • 產出范圍:≥ 90 Gb
  • 每次運行reads數:≥ 300 M
  • 最大讀長:2 × 150 bp

雙操作模式,靈活性強

按照批準的測序工作流程開發診斷檢測,可利用流程中未來的NGS IVD檢測,同時能保持在研究環境中工作的靈活性,將多種Illumina測序方法用于廣泛的應用。

臨床儀器的一致性

儀器和測序試劑都已獲得FDA批準,按照設計控制原則開發,生產符合現行藥品生產質量管理規范(cGMP),并驗證了檢測性能的一致性。

在NextSeq 550Dx系統上,設計您自己的NGS方案

NextSeq 550Dx可與TruSeq Custom Amplicon Kit Dx文庫制備試劑盒和NextSeq 550Dx Reagent Kit聯合使用,是IVD開發工具包的一部分,可讓臨床實驗室設計具有受監管組件的臨床檢測。

illumina MiSeqDx

第一個通過FDA和CE-IVD注冊、中國CNDA批準的NGS平臺,可用于臨床體外診斷(IVD)領域。

  • 產出范圍:540 Mb–15 Gb
  • 每次運行reads數:12-25 million
  • 最大讀長:2 × 300 bp

經過FDA批準的NGS系統

MiSeqDx系統是第一臺經過FDA批準、適用于體外診斷(IVD)檢測的NGS平臺。MiSeqDx儀器滿足嚴格的性能特征,這樣您能夠確信您生成了準確可靠的數據。有了MiSeqDx系統,臨床醫生和臨床實驗室如今就能夠獲得全面可靠的DNA測序結果。

不斷擴展的IVD目錄

MiSeqDx系統專為臨床實驗室而設計,使得廣泛的測序應用如今觸手可及。兩款經FDA批準的囊性纖維化檢測目前已經上市,而一款FDA批準的通用試劑盒讓您能夠創建和采用您自己的NGS分子診斷檢測。

輕松的NGS流程

MiSeqDx儀器提供了一個易于上手的自動化流程。直觀的觸摸屏界面讓儀器操作倍感輕松。即插即用的試劑和RFID追蹤提升了安全性和便利性。MiSeqDx儀器不需要輔助硬件和計算資源,節省了寶貴的實驗室空間。

用戶友好的直觀軟件

在您創建和設置您的樣本表,然后上樣測序試劑槽(預先加載試劑)時,用戶友好的觸摸屏界面將全程給您指導。在運行過程中,您可以監控質量統計數據。在DNA測序完成時,系統軟件將分析檢測數據,并生成結果報告。

illumina MiniSeq

MiniSeq系統是illumina迄今為止最簡單、最小巧且最經濟的解決方案。讓久經考驗的Illumina NGS技術來加速推進您的研究。在您自己的實驗室中,按照您自己的時間表,開展范圍廣闊的靶向DNA和RNA應用。MiniSeq擁有直觀的按鍵式操作和輕松的數據分析,高度靈活,可以滿足各種研究需求。

  • 產出范圍:1.65-7.5 Gb
  • 每次運行reads數:700-2500萬條
  • 最大讀長:2 × 150 bp

最經濟的臺式測序儀

MiniSeq系統作為我們門檻最低、最易于實現的測序解決方案,帶來了久經考驗的Illumina新一代測序(NGS)技術的強大功能和信心。即使是少量的樣本,它也能夠實現經濟高效的測序。它簡化的工作流程可實現對DNA和RNA的快速測序。小巧的體積可與實驗室無縫整合,且不需要專門的輔助設備。

靈活的NGS系統,適合多個應用

MiniSeq系統提供了跨應用的靈活性,讓研究人員能夠在針對DNA和RNA應用的不同測序項目之間輕松轉換,包括信號轉導通路分析、實體瘤和血液腫瘤分析,以及生殖系突變分析。我們提供經過優化的數據分析流程,適合不斷增長的應用生態系統。

從文庫到結果的NGS簡單流程

MiniSeq系統將上樣即運行的操作與直觀的用戶界面相結合,帶來了一個快速簡單的NGS流程。MiniSeq系統將克隆擴增、邊合成邊測序和堿基檢出整合在單個臺式儀器中,而不再需要其他設備。只需將流動槽和試劑槽上樣到MiniSeq系統中,按下按鈕即可開始測序。

友好直觀的軟件

MiniSeq系統特有觸摸屏界面和友好直觀的軟件。利用機載軟件可以設置、啟動、監控和分析測序運行。通過任何web瀏覽器與MiniSeq系統連接,可查看實時數據和性能指標。BaseSpace Sequence Hub讓您輕松并安全地分析、存檔和共享測序數據。按鍵式的工具簡化并加速推動了信息學。

illumina iSeq

iSeq 100測序系統讓新一代測序比以往更加方便和經濟。它設計簡潔,可提供快速、高效的低通量測序,使各種規模的實驗室都能一鍵完成DNA和RNA測序。

  • 最大產出:1.2 Gb
  • 每次運行reads數:4 million
  • 最大讀長:2 × 150 bp

經濟適用的臺式測序儀

iSeq 100系統擁有互補金屬氧化物半導體(CMOS)技術帶來的速度和性價比,以及邊合成邊測序(SBS)化學技術的高度準確性,讓幾乎所有實驗室都能充分利用強大的新一代測序(NGS)技術。

利用NGS深入探索

通過提供與qPCR和桑格測序相比更高的數據分辨率和更深的覆蓋度,iSeq 100系統能夠實現更高的統計置信度,從而檢出變異或低頻率等位基因。iSeq 100系統可作為現有NGS系統的補充,或作為將NGS初次介紹給客戶的產品。

提高實驗室效率和自主性

iSeq 100系統提供了更強的測序能力來滿足當前工作流程的需求,同時確保提供一貫可靠的Illumina數據質量。iSeq 100系統可用于執行小型項目,避免了在高通量儀器上運行較小樣本批次產生的浪費,可用于在大規模運行前評估文庫或進行原理論證研究。

靈活可變的NGS系統適合多種應用

iSeq 100系統能夠在多種DNA和RNA測序應用之間靈活切換,包括小基因組測序、靶向基因測序和基因表達分析。它還與目前最快的文庫制備流程兼容。

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